En 1987 se constituye el Sistema Estatal de Comunicación Cultural y Educativa del Gobierno del Estado de Querétaro con el objetivo  de  generar un espacio a la difusión y promoción del quehacer cultural, el rescate de las costumbres y tradiciones  en nuestro estado, así como la difusión  de los programas de asistencia social y  la obra del gobierno

El 4 de  febrero de 1988  nace la emisora cultural de gobierno del estado, Radio Querétaro con la frecuencia 1150 de amplitud modulada.

A lo largo de su vida  la emisora cultural ha logrado varios premios y reconocimientos  nacionales  e internacionales por  su calidad radiofónica.

Con el  programa “Al Despertar de las Pirinolas” se obtuvo el primer lugar como mejor programa  en un concurso organizado por la Unión Latinoamericana y del Caribe de Radio y Medios para América  Latina.

Con el programa “Redes” de transmisión a nivel nacional se logró el segundo lugar  en el concurso de producción radiofónica que organiza la Red Nacional de Radiodifusoras y Televisoras Culturales y Educativas.

El 28 de junio del año 2005 Radio Querétaro  da un giro de 360 grados, cierra transmisiones en amplitud modulada  y abre una nueva ventana a  la cultura, la diversión y  la información  en la Frecuencia  Modulada 100.3

En esta nueva frecuencia Radio Querétaro  ha innovado con distintos programas en vivo dando oportunidad a los nuevos valores de  nuestra música (de lo popular hasta la música de concierto). El  patio ha albergado exposiciones de pintura y escultura    de  grandes   talentos queretanos.  El  21 de marzo  se realizó   por primera vez en Querétaro el programa “Verso a Verso”,  doce horas de poesía donde  contamos con la presencia de grandes personalidades de la literatura.

Cabe destacar que con este tipo de programación Radio Querétaro ha logrado posicionarse   en el gusto de los radioescuchas.

Radio Querétaro forma parte de la Red Nacional de Radiodifusoras  y Televisoras Culturales y Educativas.

Actualmente Radio Querétaro 100.3 FM  realiza  intercambios culturales con otras emisoras  con el objetivo de brindar a los radioescuchas una programación variada y enriquecedora, como Radio UNAM, Radio Francia Internacional,  Radio Nederlands y la  Radio Exterior de España  por mencionar algunas.